2000年(nian)，杭(hang)(hang)州市(shi)(shi)(shi)(shi)九(jiu)屆人大(da)五次會議(yi)作出了《關于加快運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)綜(zong)合(he)(he)(he)整(zheng)治(zhi)的決議(yi)》，決定對運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)(杭(hang)(hang)州段(duan)(duan)(duan))進行(xing)綜(zong)合(he)(he)(he)整(zheng)治(zhi)。2002年(nian)，杭(hang)(hang)州市(shi)(shi)(shi)(shi)第九(jiu)次黨代會把運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)(杭(hang)(hang)州段(duan)(duan)(duan))綜(zong)合(he)(he)(he)整(zheng)治(zhi)與(yu)保護(hu)(hu)開(kai)發(fa)(fa)列(lie)為(wei)城市(shi)(shi)(shi)(shi)建設“十大(da)工程”之一(yi)。為(wei)加快京(jing)杭(hang)(hang)運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)（杭(hang)(hang)州段(duan)(duan)(duan)）的綜(zong)合(he)(he)(he)整(zheng)治(zhi)與(yu)保護(hu)(hu)開(kai)發(fa)(fa)，2003年(nian)4月(yue)成(cheng)立杭(hang)(hang)州市(shi)(shi)(shi)(shi)京(jing)杭(hang)(hang)運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)（杭(hang)(hang)州段(duan)(duan)(duan)）綜(zong)合(he)(he)(he)整(zheng)治(zhi)和(he)保護(hu)(hu)開(kai)發(fa)(fa)指揮部、杭(hang)(hang)州市(shi)(shi)(shi)(shi)運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)綜(zong)合(he)(he)(he)保護(hu)(hu)開(kai)發(fa)(fa)建設集(ji)團(tuan)有限(xian)責任公司，實行(xing)“兩塊牌子、一(yi)套班子”。2007年(nian)，杭(hang)(hang)州市(shi)(shi)(shi)(shi)京(jing)杭(hang)(hang)運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)（杭(hang)(hang)州段(duan)(duan)(duan)）綜(zong)合(he)(he)(he)整(zheng)治(zhi)和(he)保護(hu)(hu)開(kai)發(fa)(fa)指揮部更名為(wei)杭(hang)(hang)州市(shi)(shi)(shi)(shi)京(jing)杭(hang)(hang)運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)（杭(hang)(hang)州段(duan)(duan)(duan)）綜(zong)合(he)(he)(he)保護(hu)(hu)委(wei)(wei)員(yuan)會。2014年(nian)，根據市(shi)(shi)(shi)(shi)委(wei)(wei)市(shi)(shi)(shi)(shi)政(zheng)府(fu)統一(yi)部署，運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)綜(zong)保委(wei)(wei)（運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)集(ji)團(tuan)）啟動(dong)了機構(gou)和(he)體制調整(zheng)，以“事企(qi)(qi)分離，管(guan)辦分開(kai)”為(wei)原則，調整(zheng)后，市(shi)(shi)(shi)(shi)運(yun)(yun)(yun)(yun)河(he)集(ji)團(tuan)為(wei)市(shi)(shi)(shi)(shi)政(zheng)府(fu)直屬(shu)國(guo)有企(qi)(qi)業，納入國(guo)資委(wei)(wei)監管(guan)體系(xi)。
杭(hang)州市運(yun)河綜合(he)保護(hu)開(kai)發建設集(ji)團(tuan)有限(xian)責任(ren)公司為承擔政府重大專項(xiang)任(ren)務(wu)的建設類公司，以實現(xian)社(she)會效益為主(zhu)要目標，同時，以市場為導向，逐步開(kai)展資(zi)(zi)本運(yun)作和資(zi)(zi)產經營活動，增強企(qi)業造血、盈利(li)能力，兼顧經濟效益，實現(xian)國(guo)有資(zi)(zi)產保值(zhi)增值(zhi)。
公司具體負責(ze)京(jing)杭(hang)(hang)運(yun)(yun)河杭(hang)(hang)州主城(cheng)(cheng)(cheng)區(qu)段沿岸的土(tu)地開(kai)(kai)發(fa)利用、公共配套(tao)設施(shi)建(jian)設、項(xiang)目建(jian)設和(he)(he)運(yun)(yun)營管理，承擔京(jing)杭(hang)(hang)運(yun)(yun)河杭(hang)(hang)州主城(cheng)(cheng)(cheng)區(qu)段綜合(he)整(zheng)治與(yu)保護開(kai)(kai)發(fa)中相(xiang)應的資金保障，建(jian)設重點是城(cheng)(cheng)(cheng)中村改造、污染企業搬(ban)遷和(he)(he)運(yun)(yun)河水(shui)環境(jing)治理。同時，開(kai)(kai)展資本運(yun)(yun)作和(he)(he)資產經營活(huo)動，重點發(fa)展以旅游休(xiu)閑、文化創意產業為主的現代服(fu)務業，逐(zhu)步(bu)實現從單一建(jian)設類主體向(xiang)復(fu)合(he)建(jian)設經營類主體轉(zhuan)變(bian)。
公(gong)司將以中央和(he)省、市國有(you)企(qi)業(ye)改革精(jing)神為(wei)指導，以企(qi)業(ye)可持續發(fa)展為(wei)目標，以京(jing)杭運河(he)綜(zong)保(bao)規劃范圍為(wei)主(zhu)戰(zhan)場，實施“專項任務(wu)”與“投資經(jing)營”兩輪驅動戰(zhan)略，堅持土(tu)地開發(fa)、旅游發(fa)展、產業(ye)投資等三項主(zhu)營業(ye)務(wu)，努(nu)力在京(jing)杭運河(he)綜(zong)保(bao)和(he)企(qi)業(ye)經(jing)營上再創(chuang)業(ye)績與效益，力爭把集團打造成(cheng)以旅游休閑、文化創(chuang)意等現代(dai)服務(wu)業(ye)為(wei)主(zhu)，集建(jian)設、投資、置業(ye)、經(jing)營、管理為(wei)一體的(de)具有(you)一定品牌和(he)實力的(de)綜(zong)合性(xing)實業(ye)公(gong)司。